Los servidores MySQL no se actualizan de forma automatizada, deberá seguir un procedimiento manual cuidadoso.
Respalde las bases de datos que tenga actualmente (puede usar la utilidad mysqldump) en su servidor MySQL
Instale y configure su nuevo servidor MySQL (si va a instalarlo en el mismo equipo, deberá primero desinstalar la versión anterior o configurar la nueva versión para que utilice un puerto diferente del predeterminado 3306o del que estuviere usando actualmente)
Restaure sus copias de seguridad en el nuevo servidor MySQL
Sugerencias:
Preste atención a cualquier mensaje de error durante el respaldo y la restauración para prevenir que los datos se corrompan.
Asegúrese de que una vez restauradas las copias en su nuevo servidor, todo funciona bien
Si no está familiarizado con la configuración de servidores, busque la ayuda de un técnico especializado