Este error es común en Factudesk de escritorio cuando se tiene activada la opción de configuración local "No forzar Total Impuestos trasladados" y se requiere timbrar un CFDI de ingreso con concepto "exento" y "si objeto de impuestos".

Solución:

Ponga el valor en False.

Siga las indicaciones de la siguiente guía:

Configuración de nodo Total Impuestos Trasladados Factudesk V10